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ThruPLEX 文庫(kù)構(gòu)建試劑盒 現(xiàn)貨
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產(chǎn)品型號(hào):
R400492
產(chǎn)品報(bào)價(jià):
產(chǎn)品特點(diǎn):
ThruPLEX 文庫(kù)構(gòu)建試劑盒 現(xiàn)貨
Clontech現(xiàn)貨,TAKARA授權(quán)代理,微量基因組樣本起始量,歡迎咨詢?nèi)A雅干細(xì)胞!
  R400492ThruPLEX 文庫(kù)構(gòu)建試劑盒 現(xiàn)貨的詳細(xì)資料:

ThruPLEX 文庫(kù)構(gòu)建試劑盒 現(xiàn)貨

產(chǎn)品名稱(chēng):ThruPLEX Plasma-seq 96D Kit     產(chǎn)品貨號(hào):R400492

 

 
高品質(zhì)血漿來(lái)源cell free DNA NGS文庫(kù)構(gòu)建試劑
ThruPLEX® Plasma-seq Kit
· 專(zhuān)為cfDNA設(shè)計(jì):經(jīng)過(guò)優(yōu)化的修復(fù)及連接試劑
· 高品質(zhì)NGS文庫(kù):在寬廣的GC含量范圍內(nèi),可以達(dá)到高檢測(cè)再現(xiàn)性
· 起始量范圍廣:<1 ng到30 ng cfDNA量
· 快速簡(jiǎn)便:無(wú)需純化或樣品轉(zhuǎn)移的單管、2小時(shí)、3步操作步驟
· 應(yīng)用領(lǐng)域:液態(tài)活檢、ctDNA、目標(biāo)區(qū)域測(cè)序等領(lǐng)域文庫(kù)構(gòu)建
· 兼容自動(dòng)化平臺(tái):Beckman® FXWorkstation
 
■ 產(chǎn)品說(shuō)明:
ThruPLEX® Plasma-seq基于ThruPLEX技術(shù),并用于血漿來(lái)源cfDNA高品質(zhì)NGS文庫(kù)構(gòu)建。
該試劑專(zhuān)門(mén)針對(duì)cfDNA進(jìn)行優(yōu)化,在保持樣本GC代表性的基礎(chǔ)上,提升了文庫(kù)的信息容量。文庫(kù)構(gòu)建后可用于CNV分析、全基因組測(cè)序分析或是采用一些panel針對(duì)目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行捕獲富集后的DNA分析,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。
血漿樣品采用ThruPLEX Plasma-seq試劑盒制備文庫(kù),能有更好的靈敏度、更準(zhǔn)確的基因變異分析結(jié)果。與其它液態(tài)活檢的樣品一樣,血漿由于其易獲得、價(jià)值高的特點(diǎn),深受研究腫瘤學(xué)或者孕婦血漿中胎兒游離DNA科研工作者的重視。
 
圖1. ThruPLEX® 技術(shù)概要。ThruPLEX Plasma-seq Kit技術(shù)3步反應(yīng)即可完成針對(duì)cell free DNA的建庫(kù)工作。1~30 ng含量的cf DNA首先高效的進(jìn)行末端修復(fù)。通過(guò)采用莖環(huán)形接頭(無(wú)單鏈尾巴)進(jìn)行高效平端連接,降低了背景。封閉的5’端阻止了接頭-接頭二聚體形成。隨后未使用的接頭被降解,進(jìn)一步降低背景。高保真度擴(kuò)增的方式完成以上反應(yīng),并獲得含有illumina index的文庫(kù)。
(*圖片來(lái)源于Takara Bio USA,Inc.)
 
圖2. 高cfDNA文庫(kù)多樣性、更少的Unmapped Reads。ThruPLEX Plasma-seq Kit構(gòu)建的文庫(kù),具有高的多樣性和低的duplicates和unmapped reads。圖中表示cfDNA分別提取于3份血漿樣品,文庫(kù)定量采用Qubit熒光定量。Bioanalyzer測(cè)定mononucleosomal DNA在各樣品的量分別為0.09 ng、0.62 ng、15.44 ng。Pooled libraries采用illumina NextSeq 500 paired end模式測(cè)序,且每個(gè)文庫(kù)產(chǎn)生17 M到25 M reads。每個(gè)文庫(kù)在down-sampling數(shù)據(jù)至17 M reads以后,計(jì)算Duplication rates。
(*圖片來(lái)源于Takara Bio USA,Inc.)
 
圖3. 優(yōu)異的靶向測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建能力。圖中所示ThruPLEX Plasma-seq Kit構(gòu)建的文庫(kù)通過(guò)panel進(jìn)行高效捕獲,對(duì)kinome進(jìn)行深度測(cè)序分析以檢測(cè)突變。3個(gè)血漿樣品分別起始建庫(kù)量為5 ng、6.5 ng、10 ng,三次重復(fù)。目標(biāo)區(qū)域采用SureSelectXT2的ClearSeq Human DNA Kinome Panel進(jìn)行捕獲,并用Illumina Miseq平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序,平均每個(gè)文庫(kù)獲得5 M reads,目標(biāo)堿基被成功捕獲分析。
(*圖片來(lái)源于Takara Bio USA,Inc.)
 

 

ThruPLEX 文庫(kù)構(gòu)建試劑盒 現(xiàn)貨

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