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在RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究中,高質(zhì)量的RNA樣本是獲得精確數(shù)據(jù)的關(guān)鍵。然而,由于RNA穩(wěn)定性較差,很容易被RNase酶降解或變異,因此需要采用特殊的方法進(jìn)行樣本采集和保存。其中,PAXgene RNA穩(wěn)定化采血管作為一種有效的穩(wěn)定化工具,能夠在室溫下長(zhǎng)時(shí)間保持RNA的完整性,方便科研人員進(jìn)行RNA提取和下游分析。PAXgene采血管內(nèi)含有專門設(shè)計(jì)的穩(wěn)定化溶液,可以有效地阻止RNA酶的活性,使RNA得以穩(wěn)定保存,為什么說PAXgene是RNA保存必選產(chǎn)品,看看實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)就知道。
圖1 和 2顯示了儲(chǔ)存在 -20 攝氏度下靜置 PAXgene 血液 RNA 管中的血液 RNA 中相對(duì) FOS 和 IL1B 轉(zhuǎn)錄本的變化。
圖1 表示 10 名捐贈(zèng)者雙份收集并在 -20 攝氏度靜置 PAXgene 血液 RNA 管中儲(chǔ)存的血液 RNA 中 FOS 轉(zhuǎn)錄本的相對(duì)含量。使用 PAXgene 血液 RNA 套件純化 RNA 并使用定量 RT-PCR 方法特異性測(cè)定 FOS 轉(zhuǎn)錄本。將所有時(shí)間段的平均值繪制成金線,黑色垂直條表示標(biāo)準(zhǔn)差。紅色虛線表示試驗(yàn)精度(考慮單個(gè)數(shù)據(jù); |3xσT| = 1.16 CT)。
圖2 表示 10 名捐贈(zèng)者雙份收集并在 -20 攝氏度靜置 PAXgene 血液 RNA 管中儲(chǔ)存的血液 RNA 中 IL1B 轉(zhuǎn)錄本的相對(duì)含量。使用 PAXgene 血液 RNA 套件純化 RNA 并使用定量 RT-PCR 方法特異性測(cè)定 IL1B 轉(zhuǎn)錄本。將所有時(shí)間段的平均值繪制成金線,黑色垂直條表示標(biāo)準(zhǔn)差。紅色虛線表示試驗(yàn)精度(考慮單個(gè)數(shù)據(jù); |3xσT| = 1.98 CT)。在現(xiàn)場(chǎng)儲(chǔ)存長(zhǎng)達(dá)五年(60 個(gè)月)的情況下,F(xiàn)OS 或 IL1B 的相對(duì)轉(zhuǎn)錄本水平在 PAXgene 血液 RNA 管中并未發(fā)生顯著改變。所有的ΔΔCT 變化都在考慮單個(gè)數(shù)據(jù)時(shí)的總精度范圍內(nèi) ±3x(FOS:|3xσT| = 1.16 CT;IL1B:|3xσT| = 1.98 CT)。